实验室使用的PCR仪都是高精度仪器。一旦仪器出现一些小偏差很可能对实验结果产生较大的影响。因此，学会日常保养和维护是十分重要的。PCR仪的维护与保养需要注意以下问题：
1、仪器安置
仪器应安放在湿度较低、灰尘较少并远离水源和热源的地方，无腐蚀性气体或强磁场干扰。环境温度建议在18~35℃之间。仪器之间应保持50cm 以上距离，降低仪器之间的影响。
2、样品池的清洗
先打开盖子，然后用95%乙醇或10%清洗液浸泡样品池5min，然后清洗被污染的孔；用微量移液器吸取液体，用棉签吸干剩余液体，设定保持温度为50℃的PCR程序并使之运行，让残余液体挥发去除，一般5～10min即可。
3、热盖的清洗
对于荧光定量基因扩增仪，当有荧光污染出现，而且这一污染并非来自样品池时，或当有污染或残迹物影响到热盖的松紧时，需要用压缩空气或纯水清洗垫盖底面，确保样品池的孔干净，无污物阻挡光路。
4、仪器外表面的清洗
清洗基因扩增仪的外表面可以除去灰尘和油脂，但达不到消毒的效果，选择没有腐蚀性的清洗剂对基因扩增仪的外表面进行清洗。
5、使用前预热
老款的PCR仪的性能比不上新款仪器，使用前需要进行预热，不仅对仪器维护有好处，还能节约实验时间。新款的仪器升温快，但还是建议在进行实验前预热2min，这样可以有效延长仪器的使用寿命。
6、更换保险丝
先将基因扩增仪关机，拔去插头，打开电源插口旁边的保险盒，换上备用的保险丝，观察是否恢复正常。
7、定期运行维护
PCR仪器需要定期检测，视制冷方式而定一般半年至少一次。
